产品货号:
YTB4170
中文名称:
T4多聚核苷酸激酶(无3'磷酸酶活性)
英文名称:
T4 Polynucleotide Kinase(3'phosphatase minus)
产品规格:
500U|2kU|10kU
发货周期:
1~3天
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本制品是一种多聚核苷酸5'羟基激酶,可以催化ATP的γ位磷酸基团向单链或双链DNA、RNA、寡核苷酸或带有3'磷酸基团的单核苷酸的5'羟基转移。其它NTP也可产生相同的反应:5'-OH + NTP → 5'-P + NDP。
本制品缺失了3'磷酸酶活性,即不能催化3'端磷酸化多聚核苷酸的去磷酸化:3'-P → 3'-OH + Pi (最适pH为5.9左右)。特别适用于把OH-DNA/RNA-p催化转变为p-DNA/RNA-p,或把Np催化转变为pNp。
- 寡核苷酸、DNA或RNA的5'末端标记;
- 寡核苷酸、DNA或RNA的5'端磷酸化,确保后续连接反应顺利进行;
- 催化3'磷酸化的单核苷酸的5'磷酸化,产生的底物pNp可以和DNA或RNA的3'末端连接;
- 催化3'磷酸化的寡核苷酸的5'末端标记。
由大肠杆菌表达,表达基因的来源为T4嗜菌体T4 Polynucleotide Kinase的突变体。
一个活性单位是指在37℃条件下,30分钟内催化1nmol磷酸从ATP结合到5'-OH DNA所需的酶量。
组分 | 500U | 2kU | 10kU |
T4 PNK (3'phosphatase minus,10U/μL) | 50μL | 200μL | 1mL |
10×T4 PNK Buffer | 150μL | 500μL | 2mL |
保存:-20℃,有效期2年。
10mM Tris-HCl (pH7.4),50mM KCl,0.1mM EDTA,1mM DTT,0.1μM ATP,50% glycerol。
10×T4 PNK Buffer:
700mM Tris-HCl (pH7.6 at 25℃),100mM MgCl2,50mM DTT。
不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶。
- 75℃加热10min或65℃加热20分钟可使T4 PNK(3'phosphatase minus)失活,加入EDTA也可使T4 PNK(3'phosphatase minus)失活。
- 金属离子螯合剂、磷酸盐、铵根离子、大于50mM的KCl和NaCl均可显著抑制T4 PNK(3'phosphatase minus)的活性。
- 铵盐沉淀获得的DNA不能用于T4 PNK(3' phosphatase minus)的标记反应。铵盐可强烈抑制T4 PNK(3'phosphatase minus)的酶活性。
- 酶使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存。
- T4 PNK(3'phosphatase minus)催化单链DNA 5'端磷酸化的效果请参考图1。
图1.本制品催化单链DNA 5'端磷酸化的效果图。使用本制品或本公司的T4 Polynucleotide Kinase,在50μL反应体系中加入图中指定量的本制品或百奥莱博的T4 Polynucleotide Kinase,37℃孵育30分钟进行反应,65℃孵育20分钟以终止反应。取出20μL反应液,用增强型ATP检测试剂盒检测反应体系中剩余ATP的浓度,根据反应体系中剩余ATP的浓度计算出反应体系中剩余ATP的量,根据反应体系中剩余ATP的量和初始加入的总量计算出反应体系中消耗掉的ATP量,消耗掉的ATP量可以反映T4 Polynucleotide Kinase (3' phosphatase minus)和T4 Polynucleotide Kinase的激酶活性。以反应体系中加入的酶量为横坐标,消耗掉的ATP量为纵坐标作图。如图所示,本制品与T4 Polynucleotide Kinase (货号:YT513/YTB4169)相比,具有类似的催化单链DNA 5'端磷酸化效果。反应体系(50μL):70mM Tris-HCl (pH7.6 at 25℃),10mM MgCl2,5mM DTT,2μM ATP,2μM ssDNA,以及加入1μL不同浓度的T4 Polynucleotide Kinase (3' phosphatase minus)和T4 Polynucleotide Kinase。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。 - T4 PNK(3'phosphatase minus)催化3'端磷酸化DNA去磷酸化的效果请参考图2。
图2.本制品催化3'端磷酸化DNA去磷酸化的效果图。使用本制品或百奥莱博的T4 Polynucleotide Kinase,在20μL反应体系中加入图中指定量的本制品或百奥莱博的T4 Polynucleotide Kinase,37℃孵育30分钟进行反应,65℃孵育20分钟以终止反应。取出10μL反应液,用磷酸根荧光检测试剂盒检测反应体系中的荧光信号,根据荧光信号的强弱可知磷酸根的多少,荧光信号越显著,则磷酸根越多,磷酸根越多,则说明T4 Polynucleotide Kinase (3'phosphatase minus)和T4 Polynucleotide Kinase具有显著的磷酸酶活性;反之则没有磷酸酶活性。以反应体系中加入的酶量为横坐标,检测到的荧光值为纵坐标作图。如图所示,本制品不具有催化3'端磷酸化DNA去磷酸化的活性,而T4 Polynucleotide Kinase具有催化3'端磷酸化DNA去磷酸化的活性。反应体系(20μL):70mM Tris-HCl (pH7.6 at 25℃),10mM MgCl2,5mM DTT,15μM ssDNA (3'端磷酸化),以及加入1μL不同浓度的T4 Polynucleotide Kinase (3' phosphatase minus)和T4 Polynucleotide Kinase。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
- DNA 5'末端标记:
- 参考如下表格设置反应体系:
成分 用量 底物DNA 1~20pmol 10×T4 PNK Buffer 2μL [γ-32P or γ-33P]-ATP(3000Ci/mmol) 20pmol Nuclease-free Water 至19μL T4 PNK(3'phosphatase minus,10U/μL) 1μL - 按上表设置好反应体系后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用Vortex在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。
- 37℃孵育30min。
- 加入1μL 0.5M EDTA(pH8.0)混匀,以终止反应。
- 后续可以使用酚氯仿抽提、乙醇沉淀等方法纯化标记的DNA,也可以使用适当的DNA纯化试剂盒进行纯化。产物DNA纯化试剂盒可以向百奥莱博订购。
- 参考如下表格设置反应体系:
- DNA 5'末端磷酸化:
- 参考如下表格设置反应体系:
成分 用量 底物DNA 1~20pmol 10×T4 PNK Buffer 2μL 0.1mM ATP 1μL Nuclease-free Water 至19μL T4 PNK(3'phosphatase minus,10U/μL) 1μL - 按上表设置好反应体系后,轻轻混匀(可以用移液器吹打混匀或用Vortex在最低速度轻轻混匀),随后离心沉淀液体。
- 37℃孵育30min。
- 加入1μL 0.5M EDTA (pH8.0)混匀,以终止反应。
- 后续可以使用酚氯仿抽提、乙醇沉淀等方法纯化标记的DNA,也可以使用适当的DNA纯化试剂盒进行纯化。产物DNA纯化试剂盒可以向百奥莱博订购。
- 参考如下表格设置反应体系:
- 其它用途可以参考上述用途或相关文献资料进行。
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